Wenn der Contoller den Motor regelt in Strom bzw Drehzahl könnten deine Werte von einer PWM Regelung kommen da hast du keinen Linearen Stromverlauf im Shunt sonden auch die PWM Pulse. Du müsstest es mit einem Kondensator auf der Eingangseite des LMs ausprobieren und die Spannung mal ein bisschen Puffern
Gruß
Der Dani