Pero eso ya no se usa (en líneas generales), yo recuerdo trabajar con micros mas chicos que éstos y en Assembler implementaban todas las señales.
Hacerlo con Arduino no es problema.
Quieres crear funciones RTC, CTS, DSR y DTR. No hay problema. Pines tienes pero tendras que reescribir todo a nivel mas bajo.
Busca en AVR porque eso esta hecho.
Acá lo que te acabo de mencionar http://www.avrfreaks.net/forum/usings-cts-and-rts-atmega-microcontrollers
y alguna ayuda mas
http://www.avrfreaks.net/forum/handling-rts-cts-uart