Danke für die Tipps mit den diversen Bibilotheken.
Halfen mir bei meinem Könnensstand aber leider nicht weiter:
SduFat war nicht kompilierbar, auch nicht wenn ich versuchte die üblichen Änderungen für die Arduino IDE 1.0 zu integrieren....
SdFAT kompiliert zwar, aber gibt ErrorCodes raus: SD errorCode: 0X1 bzw.SD errorData: 0X0
tinyFAT kompilierte, gab aber immer ein ***** ERROR: MBR Signature error raus.
Insgesamt ist aber mein SD-Kartenreader wohl auch auf der Hardwareseite etwas wackelig. Die Pegelanpassung 3,3V der SD-Karte mit den 5V des Arduino Mini realisierte ich über Widerstandsnetzwerke, bzw. über einen 74HCT244 Treiber. Mit dem Resultat, daß auch mit meiner Standard Sd Lib nur einer meiner beiden SD-Adapter überhaupt läuft, und dieser auch nur mit einer von 4 getesteten SD-Karten.
Letztendlich sind aber auch die potentiell 3 kB gespartes EPROM (falls ich tinyFAT zum laufen bringen würde) mittelfristig eh nicht ausreichend, da ich noch weiteren Code für Sensorfilterung etc. implementieren muss.
Ich werde mich wohl eher in Richtung einer Kopplung mit einem zweiten Arduino und Aufteilung der Arbeit (und Speicher) hin orientieren. Zwei Arduino Pro Mini sind halt deutlich kleiner und billiger als ein Mega2560.
Zur Kopplung werde ich mich wohl später wieder melden 
Tütenflieger