Ciao Cipsy, questi problemi "non capitano", diciamo che vengono "fatti capitare" quando si fanno manovre strane con l'alimentazione o con carichi eccessivi; nel tuo caso il problema potrebbe essere più banalmente quello di aver usato un comando della seriale ad inizio sketch, quindi dovresti ricorrere alla manovra di emergenza (reset manuale), cercala sul forum e la trovi rapidamente.
Non hai specificato di che Arduino si tratta, se il quarzo è vicino l'ATmega328P deve essere Arduino Duemilanove, in caso contrario deve trovarsi vicino l'ATmega16u2.
A prescindere, ma è importante sapere di cosa stiamo parlando, un quarzo non riscalda, quindi o è un problema di induzione, cioè di un componente vicino che sta facendo bollire anche il PCB, oppure c'è una drammatica problematica di alimentazione.
Quindi dovresti fornire maggiori informazioni, soprattutto su ciò che è capitato realmente, facendo una ricostruzione degli eventi.