Controller completi per CNC ormai te li tirano dietro per 50/70 euro.
I driver dei motori sembrerebbero essere piuttosto "primitivi", io li cambierei con dei più moderni STEP/DIR e a quel punto puoi pensare di mettere anche un firmware tipo il Marlin (che nasce per stampanti 3D, ma va bene anche per piccole CNC) e funziona bene anche con un Arduino Mega.
Quello che non mi piace granché di questa macchina è la tavola XY completamente a sbalzo, fonte sicura di vibrazione (e problemi).