Nein, du kannst den Quellcode ja nicht im Nachhinein beeinflussen. Die Lösung des Problems ist dann wohl, die Daten im Eeprom abzulegen. In der setup-Routine wird der entsprechende Eepromwert geladen, in der loop kann er dann entsprechend geändert und auch wieder gespeichert werden. Beim nächsten Start des Mikrocontrollers wird wiederum der aktualisierte Wert aus dem Eeprom geholt usw..
Aber Vorsicht! Unendlich oft darf man das nicht machen, das Eeprom hat nur eine begrenzte Anzahl von Speicherzyklen!