Se vuoi usare la modalità api devi scrivere uno sketch che ti gestisca i pacchetti...
non è semplicissimo...
Devi vedere come è costruito un pacchetto e scrivere un codice che lo traduca.
Io sto cercando di fare una cosa del genere.. ma con un sensore di temperatura e senza il secondo arduino.
Potresti farlo anche tu... il led dovrebbe essere più semplice del sensore di temperatura.
Inizia a vedere per xbee serie 1 nel capitolo dedicato alle api come è fatto il pacchetto..
http://www.dr4gone.eu/forum/Manuale_Xbee_serie_1.pdf
Ti potrebbero essere utili anche questi link. (metto il link alla mia discussione. Li ci sono tutti i link utili)
http://arduino.cc/forum/index.php/topic,101961.0.html
P.s. fai attenzione io uso la serie 2, quindi i pacchetti sono diversi.