Da er sich auf den Arduino Nano bezieht denke ich das die 3.3V abrauchen diese kommen bei den Nanos aus dem FTDI chip wird diese Spannung überlastet dann geht der FTDI hoch und dadurch lassen sie sich auch nicht mehr programmieren und werden auch nicht mehr vom Rechner als Serielle Schnittstelle erkannt. Du solltest Lieber 1 BEC installieren eine für 5V und eine für die 3.3V einn kleinen Linear oder buckbuck regler damit dürfte der Aufbau besser sein.
Gruß
DerDani