Na minha opinião, é difícil responder à sua questão, pois isso depende daquilo que pretende alcançar. Qual é exactamente o seu objectivo? Pessoalmente, penso que os kit's são um pouco caros, não trazem muito material e possivelmente fique mais barato e vai ficar melhor servido se comprar o material que realmente necessita.
Em relação à questão do material compatível, e uma vez que tem conhecimentos na área da informática, o Arduino é Open Hardware (semelhante ao software Open Source, mas neste caso para o Hardware), sendo assim a informação necessária para construir um Arduino é de acesso livre e gratuito, desta forma, não há grandes razões para uma board compatível não ser de qualidade semelhante à do original, se não superior (dependendo dos fabricantes).