PaoloP:
Nella prossima versione IDE dovrebbero aggiungerlo.
Occorre aggiornare AVRdude --> Unable to program AVR chips via Atmel ICE with IDE 1.6.7 · Issue #4368 · arduino/Arduino · GitHub
visualmicro usa direttamente il tool atprogram, quindi è bastato creare i file di config jtag e isp