Es muy raro que no te funcione el ISP. Yo no he probado a usar un arduino para programar una placa. De todas formas, mira bien con lupa las soldaduras para que no haya ningún corto.
Solo el LED de alimentación, te indica que no tienes el bootloader de Arduino. Es normal hasta que no descargues el bootloader. Puedes probar a usar AVR studio 5 y FLIP, el micro tiene su bootloader de fabrica, con lo que podrías descargar un programa vía USB. De esta forma pruebas que has montado bien la placa. Siguiendo las indicaciones de JMN debería ser muy simple.