Inget som jag känner till men det står å andra sidan ingenting om att använda de analoga ingångarna som digitala ingångar.
Databladet för ATmega2560 nämner att A6 extraknäcker som JTAG Test Data Output men det betyder nog inget i ditt fall.
Kanske läge att testa om D60 fungerar som den ska med en annan sketch som inte innehåller något annat.
Något i stil med detta kanske?
void setup() {
pinMode(60, INPUT_PULLUP);
Serial.begin(9600);
}
void loop() {
Serial.println(digitalRead(60));
delay(200);
}