Un grand merci à vous tous, j'ai reprogrammé ma MEGA 2560 avec OPTIBOOT et tout fonctionne parfaitement :
Plus de soucis avec les 3 points d'exclamation ( !!! )
Le Watchdog fonctionne à merveille !
Pour ceux dans le même cas que moi :
Méthode pour reprogrammer sa MEGA 2560 avec OPTIBOOT en utilisant un Arduino UNO
Prévoir un condensateur 10µF
J'utilise la version Arduino 1.5.6-r2 BETA je ne sais pas si cela fonctionne avec d'autre versions
Sur PC allez dans le dossier d'installation du programme Arduino.
Chez moi : "C:\Program Files (x86)\Arduino"
allez jusqu'à : "C:\Program Files (x86)\Arduino\hardware\arduino\avr\bootloaders\ "
Si vous voulez faites une copie de sauvegarde du dossier "stk500v2"
Ou allez directement dans :"C:\Program Files (x86)\Arduino\hardware\arduino\avr\bootloaders\stk500v2"
Et remplacer les fichiers :
- stk500boot.c
- stk500boot_v2_mega2560.hex
Par ceux-ci :
Google Code Archive - Long-term storage for Google Code Project Hosting.
stk500boot.c
stk500boot_v2_mega2560.hex
Ensuite démarrez le logiciel Arduino et chargez le sketch d'exemple ArduinoISP
Téléversez-le dans votre Arduino UNO comme d'habitude. Arduino UNO "nue", pas de cablage avant le téléversement.

Débranchez tout et câblez la UNO sur la MEGA 2560:
Uno |
--> |
Mega 2560 |
5V |
--> |
5V |
GND |
--> |
GND |
10 |
--> |
Reset |
11 |
--> |
51 |
12 |
--> |
50 |
13 |
--> |
52 |
Le Condensateur 10µf entre GND et RESEST de la UNO (pate - du condo sur GND et l'autre sur reset)
En images :
Rebranchez le port USB sur la carte UNO
et même si c'est une UNO de branchez choisissez dans le menu :
Outils\ Type de carte\ Arduino Mega or Mega 2560
Toujours dans le menu outils changez le programmateur pour :
Arduino as ISP
Et encore dans le menu Outils choisissez :
Gravez la séquence d'initialisation
Voilà ça dure quelques minutes et en fin de procédure un message d'erreur apparait
:
avrdude: verification error, first mismatch at byte 0x3e000
0x0d != 0xff
avrdude: verification error; content mismatch
N'en tenez pas compte 
La méga 2560 est passée sous Optiboot 8)
Merci à fdufnews pour avoir identifié le problème
Merci à B@tto qui ma aidé à le resoudre.