Considera che :
1. Arduino DUE è molto poco supportato e pochissime librerie di terze parti sono state convertite per funzionarci.
2. Molti pochi shield sono fatti per funzionare su Arduino DUE.
3. La scheda funziona esclusivamente a 3.3V e molti dei suoi pin sono in grado di dare un decimo della corrente (max 3 mA) dei pin degli altri Arduino (max 40 mA). I rimanenti comunque non danno più di 15 mA.
4. E' sicuramente un processore molto più complesso da utilizzare. Basta guardare le oltre 1400 pagine di cui è composto il datasheet
5. Difficilmente vedrà ulteriori sviluppi dato che ... ora c'è da dedicarsi alle nuove schede.
Insomma ... salvo tu non abbia esigenze veramente particolari e l'esperienza per utilizzare tale scheda, se è solo per una questione di numero di pin e di memoria ... usa Arduino Mega 2560 ... avrai tutto il supporto di cui puoi avere bisogno e la totale compatibilità con la maggior parte degli shield.
Guglielmo
P.S. : Gli Arduino Mega 2560 che trovi a 30 € ... sono probabilmente dei cloni e non schede originali ... quindi ...
... a tuo rischio ... 