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das bezieht sich auf den Stecker zwischen A4988 und Motor, nicht auf die Stromversorgung des Arduino oder der Motore. Ich würde erst die Motorspannung und danach die Logikspannung abschalten.
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Zum Einstellen des Max-Stromes muß nur der Logikteil des A4988 mit Spanung versorgt werden
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laut Datenblatt http://www.pololu.com/file/0J450/a4988_DMOS_microstepping_driver_with_translator.pdf ist der Max Strom (bei 100% Ansteuerung) Imax=Vref/(8xRs)
Rs sind die Widerstände die zwischen H-Brücke (pins Sense1 und Sense2) und Masse geschaltet sind um den Strom zu messen.
Vref ist die Spannung am Vref -Pin.
Beides kann ich ohne den Schaltplan Deines A4988 Moduls zu kennen nicht erahnen. Darum kann ich den von Dir vorgeschlagenen Wert nicht bestätigen.
Bei 1,7A Motorstrom ist ein Kühlkörper auf dem A4988 notwendig.
Grüße Uwe